其中最重要的是原药质量不同。比如天然牛黄、天然麝香，是需要经过国家特批，才可以使用的，并不是所有的药厂，都可以使用天然牛黄、天然麝香来入药的。再加上天然牛黄货源不稳定，有的需要进口，甚至从国外进口，都无法满足需求量，导致天然牛黄的价格，比黄金的价格还要高。牛黄具有清热解毒、镇静豁痰、息风止痉的作用。天然牛黄是牛胆囊的胆结石，人工牛黄是从猪胆汁中提取的药物秘制而成，两者之间是有本质区别的，疗效、价格也相差很多。麝香也一样，人工麝香的价格，相对比较低一点，这就是造成安宫牛黄丸的价格差距的重要的原因。再加上生产工艺制作上的不同，有些厂家，比如北京同仁堂，采用传统工艺与现代工艺，相结合的方式生产，生产严谨、工序有一百多道，严谨的工艺使药物可以更好地发挥药效，但也导致了人工成本的增加。北京同仁堂的安宫牛黄丸，采用天然牛黄、天然麝香的同时，还在药丸的外面包裹了一层金箔，要是想把黄金制成金箔，不仅需要较高纯度的黄金，还需要千万次的锤炼，才能使黄金变成薄如蝉翼的金箔，这时的黄金，才可以作为食用药用的原料。而有些安宫牛黄丸，是不包金箔的，因此也是造成安宫牛黄丸，价格有一定的差异。

清热解毒、镇惊开窍。安宫牛黄丸主要是由牛黄、水牛角、麝香、珍珠、朱砂、雄黄、黄连、黄芩、栀子、郁金、冰片等几味药物组成的，它的作用主要是清热解毒、镇惊开窍，用于热病、邪入心包、高热惊厥、神昏谵语、中风昏迷等疾病。临床上主要用于严重的感染或者是败血症病人出现高热，发热以后出现意识障碍比如昏迷，安宫牛黄丸能够起到开窍醒脑的作用。其次用于脑炎、脑膜炎、中毒性脑病，这类病人出现神志系统的问题和肢体的问题，那么安宫牛黄丸能够开窍醒脑、止惊、止痛缓解病人抽搐的症状。安宫牛黄丸用于脑血管病引起的脑出血脑或者是由于头颅外伤诱发的出血，病人出现神昏高热等情况，安宫牛黄丸能够起到退热、凉血、镇惊以及开窍的作用，帮助病人恢复神志。