脊柱裂并发症可发生下肢青紫和水肿，容易发生营养性溃疡，甚至坏疽，常有肌肉挛缩，有时有髋关节脱位，马蹄足畸形等。
脊柱裂伴发畸形，脊柱裂可能伴有一些其他少见的畸形如：
(1)脊髓内积水：多发生于胸椎部、胸腰部或腰骶部，很多液体积留在脊髓中央管，囊内只有萎缩的脊髓组织。
(2)无脊髓：脊髓未发育常伴有无脑畸形，出生后很快即死亡。
(3)皮样囊肿、脂瘤或畸胎瘤组织：可能侵入硬脑膜或脊髓。同时存在的畸形与脊柱裂同时存在的畸形较常见的有脑积水、畸形足、颅骨腔隙、脑膜膨出、脑膨出、唇裂、先天性心脏病等。