1.痛性结节形成 输精管结扎术后，由于手术损伤引起的组织反应，局部可形成小结节，一般于术后1～2个月内结节逐渐缩小，不遗留任何症状。但也有发生痛性结节者，多由于血肿、感染、线头异物、神经纤维瘤或精子肉芽肿的形成所引起。故无菌操作、完善止血(避免损伤输精管动脉)、外膜内结扎输精管(以免误扎周围神经)以及结扎松紧适当(避免松脱或割裂管壁后精子外溢)均为术中应注意的事项。长期不愈的痛性硬结，可用药物、热敷及理疗治疗，如不见好转，可考虑将结节切除。
2.附睾淤积 少数受术者于术后间歇发作附睾肿大及胀痛，可能与精子淤积有关，大多均能自愈。预防方法在于手术时选择远离附睾尾处的输精管结扎，留有缓冲余地。
3.性功能障碍 此种并发症极为少见。术前普及科学知识，解除思想顾虑，讲解正确的性知识，做好家属工作，至关重要。一旦出现些症状，应了解情况具体分析，细致做好思想工作，消除误解，加用中西医结合治疗予以解决。如有慢性前列腺炎等器官性病变，应予治疗。万不得已时，也可行输精管吻合术，作为一种精神治疗，常可奏效。
4.再生育 输精管结扎术后发生再生育者，多与以下几种因素有关：
⑴结扎后残余精子未予认真处理，也未作短期避孕。
⑵手术者当时误扎其他组织，而输精管却未被结扎。
⑶结扎切断的输精管又重新自行连通。
⑷先天性输精管异常，除有正常输精管外还存在副输精管。
5.血肿形成 由于手术止血不妥或损伤血管，可引起阴囊切口渗血、精索血肿或阴囊内广泛出血，大都出现在手术后24小时之内。切口渗血是由于皮肤切口边缘小血管止血不完善所引起，一般更换敷料后加压包扎，或必要时加缝一针，即可制止。精索鞘膜内血肿是由于术中损伤蔓状静脉丛所引起，一般可用冷敷、加压包扎和止血药物止血。阴囊内严重广泛出血，大都是在分离和寻找输精管时损伤了精索动脉或输精管动脉所致，出血量极多，可达1000～2000ml，以致阴囊极度肿大，表面呈青紫色，沿腹壁浅筋膜深层(scarpa)扩展至下腹部和会阴部，沿会阴浅筋膜(colles)扩展至外生殖器[图26-5]。必须立即施行手术止血，纠正失血，清除血块并彻底引流，以防术后产生其他并发症。
6.感染 多与手术前未妥善准备皮肤、灭菌不够严密(包括手术野、手术器械、缝线等)、手术操作粗糙、止血不完善、术后敷料脱落、伤口污染等有关;也有少数病例与生殖道内的潜在感染有关。感染可限于切口，也可以扩展为精索炎、附睾炎、前列腺炎或精囊炎，应根据情况予以治疗。