男人小便疼痛一般是身体缺水、剧烈运动、膀胱炎、前列腺炎、尿道结石等原因所致，可就医查明原因后，根据原因进行一般治疗、药物治疗、手术治疗等改善。
1、身体缺水：身体缺水会致使尿液过度浓缩，排尿时尿液刺激尿道，就会引起疼痛。可以增加饮水量改善，保持每日饮水1000-1300mL，期间也要避免吃辛辣食物，如辣椒、胡椒等。
2、剧烈运动：长时间的剧烈运动可能导致尿道部位受到摩擦，即可造成尿潜血、尿痛。可以适当休息缓解，之后也要调整好运动时间和运动幅度，以免再次引发不适。
3、膀胱炎：膀胱部位受到炎症的刺激，患者在小便时可能就会出现疼痛，还可存在尿频、尿急等。可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等药物，抗菌消炎。期间也要勤换洗内裤、避免憋尿，从而促进身体恢复。
4、前列腺炎：患者多会以腹痛、尿痛、尿急等为主要症状，和炎症频繁刺激前列腺有关。需要及时遵医嘱使用药物治疗，如非那雄胺片、注射用头孢曲松钠等，加速炎症消散。期间需避免久坐，适度散步或做体操等温和运动，才有助于前列腺恢复。
5、尿道结石：结石挤压或刺激尿道，会致使排尿受阻，引发疼痛、排尿困难。可以先遵医嘱使用尿石通丸、排石颗粒等药物治疗，症状严重的患者，则需要及时进行手术治疗，如经皮肾镜取石术、输尿管软镜碎石术等，从而取出结石。
建议平时勤用温水清洗私处，降低细菌感染的几率，如果有不适，尽量避免同房，以免交叉感染影响身体健康。