上海市第九人民医院眼科是临床重点专科建设学科、上海市重点学科，是以眼整形眼眶病为特色，白内障、青光眼、视网膜病、眼表角膜病、屈光斜弱视等各亚专业全面发展的综合性学科。学科集医疗、科研与教学为一体，附设上海交通大学医学院眼科视觉科学研究所和上海市重点学科眼科实验室，是目前国内眼整形眼眶病领域规模的研究和治疗基地。九院眼科积极开展优质护理服务，加强临床路径管理。学科拥有长江学者特聘1名，博士生导师3名，硕士生导师9名，职称18名，博士学历占53%，开放床位90张，眼科专用手术室9间，年门诊量11.3万，年手术量1.27万台。三年内获得上海市重点学科建设经费1200万，医疗设备购置经费1768万，三年内获得自然科学基金14项，科技部“十一五”支撑计划、“973计划”、“863计划”和教育部“985工程”等子课题各1项，省部级课题18项，发表论文114篇，其中SCI收录65篇，作为完成单位获教育部科技进步二等奖2项，上海市科技进步一等奖1项，上海市科技进步二等奖2项。