大坪医院胸外科是博士学位授权学科、教育部重点学科、全军胸外科专科中心、重庆市首批重点学科。开展床位100张，工作人员60多名，其中主任医师、3名，副主任医师、副8名，主治医师、讲师8名，博士生导师3名，硕士生导师6名，国内外博士后3名，主系列人员全部已获博士学位。学科已培养博士生32名，硕士生45名，专科进修生70多名。先后3人获特殊津贴，1人被评为全军教师，2人获军队育才金奖，3人获军队育才银奖，1人获重庆市争光贡献奖。科室以食管疾病、肺疾病和重症肌无力的外科治疗为重点，不少技术为全国领先，部分技术为世界首创。近年来以电视胸腔镜手术等微创胸部诊治为特色，收治病人来自全国各地。先后获军队医疗成果一等奖1项、军队及省部级科技进步奖或医疗成果二等奖7项、三等奖9项，主编学术专著13部，参编全国七年、八年制全国统编教材《外科学》等专著25部，发表国内外学术论文700余篇。先后被评为总后勤部“十隹文明服务先进单位”、“先进党支部”，重庆市“精神文明建设先进单位”，第三军医大学“校基层建设标兵单位”和“党风廉政建、科研工作先进单位”。荣立集体三等功二次，共有30多人分别受校、院嘉奖，6人荣立三等功。蒋耀光荣获重庆市第二届争光奖。该科以食管外科、肺外科、重症肌无力外科治疗、胸腔镜外科为学科重点，形成自已特色和优势，学科整体居于国内领先水平。