1955年张金哲院士开创小儿外科事业以来，普通外科专业一直是重点专业和基础专业，并由此派生出其他专业。现有病床30张，每年平均完成手术500余例。40多年来，儿童常见外科疾病如先天性巨结肠，已治疗近3000余例，手术方式从张金哲发明改进的环钳方法，到使用胃肠吻合器，再到近年来实行的腹腔镜术和经肛门改良soave术式取得了一系列成绩，国内享有声誉，亦有影响。经过实验研究对先天性胆总管扩张症，设计应用了加强防返流措施的胆道-空肠Y型吻合加矩形瓣成型术，有效地防止返流。我院设计的这种胆肠吻合防返流矩形瓣手术，得到了国内同道的推广应用。此设计也引起了上的兴趣，日本仙台（胆道闭锁手术创造单位）将此手术引用为常规技术。到目前为止，此类手术已做300余例，近期、远期效果均较满意。

普外专业在诊断、治疗大量患儿及疑难病症的病例中，积累了大量的经验。多年来，通过医疗、科研对一些疾病如先天性肛门直肠畸形、先天性肝胆脾胰疾病等的术前诊断和术后处理均进行不断的改进与完善，对其手术技术不断的进行了创新，减少或消灭其术后并发症。肛门直肠畸形和一穴肛的功能性修复水平不断提高，对排便控制，排便功能训练的研究不断深入。肠内肠外营养已广泛用于临床。在临床、科研新型手术、方法设计方面总结发表了论文200余篇，获卫生部、北京市科技进步奖多次，并有专著数本。

本专业拥有国内外数名，并有数名拥有博士、硕士学位的医生。