肛肠科于1957年成立，至今已有50多年历史，以前是在本院二门诊部，现已搬迁到总院院部。分为门诊与病房两部分，门诊位于急救中心大楼5楼，病房现在位于新科技大楼底楼。

设有病床35张，医护人员共16名，其中副主任医师2名，住院医师4名，副主任护士1名，护士9名。每年门诊人数近万人，住院近千人，业务服务于整个渝东地区，辐射到湖北、陕西等省，规模和实力处于重庆前列。