北京大学第三医院病理科（暨北京大学医学部病理学系）历史悠久，已走过90年的风雨历程。在几代病理学工作者的辛勤耕耘和努力开拓下，科室得到了长足的发展，先后被批准为首批病理硕士点、博士点和博士后流动站，并被评为教育部重点学科（当时全国仅有的两个病理学科之一）、“211工程”重点建设学科。病理科还是北京市医疗纠纷尸体解剖中心的挂靠单位和北京大学病理中心的牵头单位。

病理科始终采取临床、教学和科研相结合的发展模式。三个部分工作相互依存、相互促进，经过几十年的发展，已具备相当规模，形成特色，具有明显的人才优势，结构合理的专业队伍，并且一直保持着临床医疗服务、教学和科研队伍的稳定。

病理科开展病理诊断工作已有70多年历史。活体组织检查累计65万余例，尸体解剖累计6000余例。

在病理学技术上，除了发展常规病理学技术，还不断扩大免疫组织化学、超微病理学和现代分子病理学技术的开展及运用。全面推进临床病理学科的内涵，在病理学检查方面达到从器官、光镜、电镜、免疫组化、基因诊断的系统化、标准化、数字化和信息化。使病理诊断从单纯的疾病认定向为治疗提供分子基础转变。还建立了冷冻组织库，使临床疾病资源得到了整个医学部基础研究的利用；建立了激光捕获及显微切割技术、组织芯片技术的平台，并服务于各学科；开展了以虚拟切片技术为核心的远程病理会诊系统，在远程病理学的硬件及软件建设中取得了明显进展。为我国临床病理工作的发展、边远地区病理诊断提供了可行性。建立了北京市医疗纠纷尸体解剖中心，负责处理北京地区疑难病例及医疗纠纷的鉴定工作，对北京市医疗工作医患关系的稳定，防止社会矛盾激化做出了贡献，承担了卫生部下达的SARS、禽流感和甲型流感应急尸体解剖任务，并为北京市周边的河北省和内蒙古自治区提供服务。在北京市卫生局的领导下，牵头成立了北京市病理质量控制委员会，并起草了的相关文件草案。以病理科牵头，建立了中国病理医师协会及起草了临床病理住院医师培训制度纲要。在病理诊断服务方面，始终坚持竭诚服务患者的理念，不断提高服务质量，防范医疗差错，完善各项诊断制度。