1.扁桃体本身的疾患如屡发的急性扁桃体炎、扁桃体周围脓肿、由于幼儿的扁桃体增生与肥大造成上呼吸道的不通畅，甚至出现呼吸困难和吞咽不便，可行扁桃体摘除术。其他如扁桃体角化症和扁桃体肿瘤等，亦可用此手术方法进行治疗。对于慢性咽炎的患者，扁桃体摘除并不能改善其症状。
2.因慢性扁桃体炎而引起邻近器官的疾患，如反复发作的急性鼻炎、咽喉炎、中耳炎、颈淋巴结炎等与扁桃体有关者，可施行扁桃体摘除术。
3.慢性扁桃体炎作为病灶而引起体内其他器官疾患者，如风湿热、风湿性心脏病、关节炎和肾炎等，均可考虑施行扁桃体摘除术。
如有以下几种情况，手术应慎重考虑或推迟进行：
1.全身性疾病的活动期，如结核病、糖尿病、血液病、精神病以及急性传染病流行时期。
2.急性扁桃体炎发作时期不宜手术，一般在发作以后3～4周方可施行手术。
3.高血压病及动脉硬化症患者，收缩压如超过20～21.3kpa不宜手术，以免出血。
4.身体软弱消瘦、年老或患有严重疾病者;年龄不到5岁的小儿多不主张手术。
5.风湿热、风湿性心脏病、关节炎及肾炎等病情尚未稳定者，不宜施行手术，妇女在月经期暂缓手术，因手术出血机会较多。