口腔科原名“牙科”，1947年创建于上海医学院附属中山医院，由席应忠主任及李学祥主治医师负责筹办。当时只设立门诊并接受各科住院病人的会诊工作。门诊室设备简陋，只有两把军用椅及一套综合治疗台。

1949年上海解放后，卫生局增派三名住院医生和一部牙科升降椅，只能做一般技术和补牙工作。

1954年全国高校院系调整，上海医学院成立口腔系，中山医院牙科改名“口腔科”，由李学祥医师代埋科主任。1955年张锡泽医师任口腔科主任。

1956年进行医疗教学体制改革，将中山医院口腔科划归临床外科教研组领导，并随组迁至华山医院，口腔科的医教研工作均由李学祥负责。

1960年口腔科门诊增配2套牙科椅及综合治疗台（国产），增加住院医师2名，开设病床4张，并开始收治住院病人。

1965年成立口腔科教研组，由李学祥任教研组主任。病床增加至8张。口腔科门诊主要解决口腔多发病，常见病的诊治，并在口腔粘膜病、牙周病、龋病、牙髓病等方面开展了工作。

1985年起高月芬任口腔科主任，更新了进口口腔椅9台等仪器。

1996年起俞立英任口腔科主任，现有专业医师16人，其中副高职以上4人，主治医师9名、住院医师各3名。