广东医科大学附属医院儿科始建于1964年，是广东省重点科室、临床医师培训基地。承担了粤西地区进修医师的培养任务，是广东医科大学儿科学专业人才教学实践基地。1986年获硕士学位授予权，是广东医科大学首批硕士学位授权点之一。

2010年1月广东医学院附属医院儿科命名为“广东医学院附属医院儿童医学中心”。中心设有4个病区，包括神经、泌尿、内分泌、心血管、消化、呼吸、血液、新生儿、重症监护等专业，共有床位150张。具有先进的仪器设备，包括呼吸机12台，纤维支气管镜1套，肺功能检测仪1台，层流床等，新生儿重症监护病房备有新生儿辐射台11张，新生儿暖箱30台，新生儿蓝光治疗仪3台，脑干听觉诱发筛查仪1台等。中心备有儿科病人救护车2辆，方便病人检查及门诊病房间转运。2012年新生儿专科获省级重点专科，血液病专科获广东省农村儿童白血病定点医疗单位。

儿童医学中心门急诊分四个部分：急诊：24小时开诊，具有完善的急救设备和急危重病人转运能力，年急诊量约5万人次；普通儿童门诊：每天均有5～6名出诊，日门诊量约400人次，开设哮喘、消化、血液和心血管等病人专科门诊；脑康复／癫痫专科门诊：每天有2名出诊，有10名康复技师，开展运动治疗、语言治疗、针灸、理疗等康复治疗手段，是粤西地区规模、康复技术全面的儿童脑和神经康复中心；新生儿（早产儿）保健及行为发育门诊：有3名出诊，主诊早产儿随访、行为发育异常如自闭症、多动症儿童的评估和治疗。

儿童医学中心具备完善的医疗条件，先后开展的先天性心脏病介入治疗、儿童肺功能检测、儿童纤维支气管镜检查术、呼吸及辅助呼吸治疗、肠道外营养、血液净化、腹膜透析等诊疗技术均在粤西地区领先水平，省内先进水平。

儿童医学中心拥有一支高素质的人才队伍，科室共有医疗专业人员144名，护士101名，技术人员14名。医疗人员中包括主任医师8名，副主任医师7名，主治医师4名，住院医师10名，拥有硕士生导师7名，博士学位获得者3人，硕士10人。儿童医学中心每年为医学院培养硕士研究生13-15名，26年来共招收儿科学硕士研究生90人，毕业59人，积累了丰富的研究生培养和管理经验。2000年儿科学被评定为广东医学院院级重点支持学科，2005年被评定为院级精品课程及课程。获南粤教师称号2人，“千百十工程”院级重点教师4人，院级名师1人。学术队伍的年龄结构、知识结构和职称结构合理，学术队伍团结协作，学术思想端正、活跃，能持续不断地进行高水平的教学和研究工作。

科室学术气氛浓厚，学科点自从建立以来，就确定了以科研为龙头，带动医疗和教学全面发展的方针，目前形成了一定的学科规模和特色、优势：学科建成了以小儿心脏病、血液病、呼吸疾病、新生儿及危重症、儿童保健康复等专业为龙头的儿童预防保健-医疗-康复一体化的儿童医学中心。学科形成了以肺动脉高压、血液病的防治、新生儿及危重症、小儿呼吸系统疾病和儿童保健康复等稳定的科研方向，近年来投入大量的人力、物力，科研成果硕果累累，近三年承担自然科学基金2项、省厅局级课题11项，发表论文48篇（SCI收录论文10篇），获广东省科技局科技成果三等奖一项。

拟将儿童医学中心建成环北部湾地区儿童保健、医疗中心及儿科医师培养基地，建成省级重点学科。