厦门市中医院中心实验室是全国中医肝病重点专科，厦门市肝病中心的专科实验室。同时承担厦门市中医院分院检验科的业务功能。设有血液、生化、免疫和分子生物学等实验室。2003年科室在厦门率先通过了卫生部临床检检中心的PCR实验室验收，成为福建省第二家，厦门市一次性通过验收的专业实验室。历年来在卫生部、省临床检验中心开展的室间质评和室内质控活动中，成绩名列前茅，均达到标准。该科室自行开发、安装了医学实验室管理系统，建立了实验室局域网，实现了实验室管理科学化、自动化和网络化。把基因扩增仪等实验仪器和网络连接，使基因扩增检验肝炎病毒核酸等项目，能够将仪器检测病毒的扩增图像打印在检验报告单上，客观、直接地提供给医生和患者。

科室现有美国BECKMAN公司LX20大型生化仪、瑞士ROCHE公司2010电化学发光免疫分析仪和法国STAGO公司STA-compact全自动血凝仪等大型设备，和日本SYSMEX公司KX-21n全自动血球计数仪、芬兰雷勃MK3酶标仪、日本京都4280全自动尿液分析仪等分析仪器有力地了日常检验工作的质量和水平。科室还拥有美国ABI公司7000型基因扩增仪、美国BECKMAN公司CEQ8000型基因测序仪等领先的大型分子生物学仪器，可从基因水平提供疾病诊疗和生命科学研究指标。目前可以检测甲、乙、丙、丁、戊和庚型等病毒性肝炎病原学指标，其中乙肝血清学指标(乙肝二对半)在厦门地区率先普及了定量检测。应用免疫印迹法检测自身免疫性肝炎诊断指标，是目前厦门地区临床检测各型肝炎血清学指标齐全的科室。还能够进行α干扰素抗体、乙肝拉咪呋啶耐药(YMDD变异)、细菌内毒素等项目检测，为病毒性肝炎的疗效观察提供了客观指标。

科室全体同仁致力于创建一个标准化、现代化科室，服务于临床和科研。科室检测项目优质、快速，结果稳定可靠，检验质量一直得到医生和患者的好评和信任。

目前科室开展的检测项目有:

1、肝功能、血脂、心功能、肾功能等生化检验项目。

2、血细胞分析，凝血四项指标。

3、肝炎病原学检测(定性：酶联免疫吸附法。定量：时间分辨法，电化学发光法，基因扩增法)。乙型肝炎定性，甲戊、丙丁庚型肝炎定性，乙型肝炎定量，乙肝病毒核酸定量，丙肝病毒核酸定量。

4、免疫学指标定量检测。肿瘤标志物：AFP(甲胎蛋白)CEA(癌胚抗原)CA125(糖类抗原125)；CA153(糖类抗原153)CA199(糖类抗原199)CA724(糖类抗原724)；PSA(前列腺抗原)FPSA(游离前列腺抗)NSE(神经角质烯醇化酶)；CYFRA211(肺小细胞癌原211)；激素：DHEA-S(硫酸脱氢表雄甾酮)T(睾酮)LH(黄体生成素)；β-HCG(绒毛膜促性腺激素)E2(雌二醇)PROL(催乳素)；FSH(促卵泡生成素)CORTISOL(皮质醇)PROG(孕酮)；甲状腺功能：T3(三碘甲腺原氨酸)T4(甲状腺素)TSH(促甲状腺素)；FT3(游离三碘甲腺原氨酸)FT4(游离甲状腺素)TG(甲状腺球蛋白)；An-Tpo(甲状腺过氧化物酶)；肝纤维化指标：HA(透明质酸)LN(层粘蛋白)PCⅢ(Ⅲ型前胶原)ⅣC(Ⅳ型胶原)。

5、其它项目：αINF(α干扰素抗体)YMDD变异(乙肝拉咪呋啶耐药)AMAM2(丙酮酸脱氢酶)；LKM-1(细胞色素P450ⅡD6)LC-1(亚氨[代]甲基转移酶-环化脱氢酶)；SLA/LP(可溶性肝抗原/肝胰抗原)ANA(抗核抗体)。