宁德市医院儿科在建院初期即开展儿科门诊及病房的建设，初始只有5张床位，医师2名，护士6名，发展到现在病床100张，其中儿科普通病床90张，儿童重症监护病床10张，设有儿内科（含肾病、呼吸、消化、神经、急救等专业），产婴室等。福建省儿童救护宁德分中心于2009年掛靠宁德市医院儿科。目前设2个普通儿科病区及1个PICU，共3个病区，主要开展儿童呼吸、消化系统及神经系统等常见病的诊治以及呼吸衰竭、重症哮喘、癫痫持续状态、心力衰竭、急性颅内高压等危重症的救治工作。儿科工作范围辐射宁德市及周边县市，年门诊超过16万人次，急诊超过2万人次，年住院人数达5000余人次。儿科现有监护仪30台，有创呼吸机3台，无创呼吸机2台，微量血气分析仪1台，输液泵20台，雾化吸入装量20台、呼出气NO检测仪等精密仪噐设备。长期以来，科室先后担任着福建医科大学临床专业、福建省卫生技术学校、福建中医药大学及莆田学院等院校学生的教学工作，积累了丰富的教学经验。全科共发表科研论文百余篇，宁德市儿童血铅调查获得宁德市科技进步三等奖，并承担宁德市畲族儿童哮喘筛查、宁德市畲族儿童尿蛋白筛查等科研工作。

儿科现有人员配置:医师23名，其中主任医师3名，主治医师7名，硕士4名；护士45名，共計58名。

宁德市医院新生儿科系福建省新生儿救护中心宁德市救护分中心，收治来自闽东地区各县市及罗源转诊的急危重症病人。由2名主任医师，2名主治医师、1名主管护士及多名住院医师、护士组成，是一个具有较高治疗水平，具有高度责任心，乐于奉献的医疗团队。新生儿科占地面积约1400m2，目前开放床位50-60张，拥有国内的新生儿高频呼吸机2台，常频呼吸机4台，无创呼吸机7台，T-组合呼吸机1台，32台蓝光治疗仪，暖箱30台，远红外线抢救台15台，具有床旁血气分析仪，脉氧仪等先进的医疗设备。目前开展新生儿呼吸窘迫综合症、早产儿肺透明膜病、肺出血、肺动脉高压、胎粪吸入综合症气胸、新生儿肺炎、DIC、早产儿、小于胎龄儿、败血症、新生感染、新生儿脐炎、新生儿脑病、新生儿颅内感染、新生儿颅内出血、新生儿病理性黄疸、新生儿ABO溶血、新生儿肠道感染、脱水、新生儿泌尿系感染等危重症新生儿疾病的诊治。小早产儿胎龄为26+7周。

无陪护的管理模式减少患儿院感的几率，同时让患儿得到更加专业的护理。