心血管外科始建于1997年4月，有我院“跨世纪人才工程”中引进的心血管外科肖明第创立并担任主任。科室成立之初，肖明第就提出以冠脉外科为重点，同时兼顾瓣膜外科、先天外科和大血管外科的发展方针。科室建立七年来，规模从22张床位发展到66张床位，其中术后监护室13张床，成为医院重点科室；共完成各种手术逾6000例，近几年年手术量600例以上，收到了良好的社会效益。

作为我国冠状动脉外科的奠基人之一，肖明第来沪后大大推动了华东地区冠脉外科的发展。我院心血管外科早大组成规模地开展冠脉搭桥手术。手术治疗的冠心病患者人数逐年迅速增加，合计完成搭桥手术约1600例，约占总手术的三分之一。近年手术患者的平均年龄高达68.8（+/-）10.8岁（年龄大者87岁）。并与本院心内科、急诊科、导管室等科室联合成立了心脏病急救中心，负责急诊搭桥手术。中心拥有虹口中心医院、吴淞医院等18家本市协作医院建立了高效的急救网络，使得需要接受搭桥手术的急性心肌梗死患者能够在短时间内得到好的治疗。

在努力提高常规冠状动脉搭桥手术水平的同时。心外科积极探索微创冠脉外科手术。1991-1998年在华东地区率先开展了诱导室颤下搭桥、不停跳（off-pump）搭桥，随后采用U-clip缝合线和symmetry静脉主动脉近端吻合器等冠脉吻合技术，此外还开展了MIDCAB以及各种小切口心内直视手术。近几年不停跳搭桥手术明显增加，已占全部冠脉手术的一半以上。

心外科1999年初在华东地区率先开展激光心肌血管重建术（TLMR）。不仅完成了78例TLMR或CABG+TLMR手术，而且跟踪随访研究了近期和中期疗效。并且开展了TLMR治疗机理的研究探讨。提出了TLMR手术的适应症和禁忌症。1999年在上海首先进行了机械臂二尖瓣置换术；2000年进行了国内首例PTCA+TLMR；2001年开展了上海首例急诊搭桥；2002开展了再次冠脉搭桥手术。2000年4月完成同种心脏移植1例，存活已接近4年生活质量良好。

另外，心外科逐步开展了主动脉瘤的外科治疗，目前已能成熟行Bentall术，半弓置换术、全弓置换＋术中支架术。2006年初开展先天性心脏病的介入治疗及夹层动脉瘤的介入治疗，目前已积累了丰富的临床经验。

心外科独立或者联合其他单位承担了多项科研课题：上海市科委“激光心肌血管重建术的临床研究”、上海市卫生局“提高冠心病外科治疗的临床研究”、上海市“危重冠心病的治疗”、卫生部“十五攻关课题――冠脉外科规范化治疗的研究”。冠心外科的临床治疗成果1999年获得上海医疗成果三等奖。

目前心外科拥有、主任医师3人副主任医师7人主治医师2人

肖明第担任卫生部技术鉴定咨询、中华医学会胸外科学会副主任委员、中国医师协会全国委员《中华外科杂志》、《中华医学杂志》、《上海医学》、《中华胸血管外科杂志》、《中国循环杂志》等杂志编委。并多次获得个人、劳动模范、党员等荣誉称号。