协和医院药剂科是集药品服务、科研、教学于一体的综合性学科。负责全院中西药品、科研用药的供应，制剂生产研制和生产，以及药品进入医院的全程质量管理；承担着培养药学专业研究生，本科生、大、中专生的教学实习任务和进修生的培训任务；同时进行临床药学，新药开发研究，临床药物代谢动力学，药物不良反应监测和研究，药学情报及计算机应用等领域的研究工作。

药剂科总人数为99人，现有主任药师2人，副主任药师5人，硕士研究生以上学历者10人，本科学历35人，药剂学硕士生导师4人。