北京中医药大学东方医院内科是教育部重点学科之一，消化内科是其重要的组成部分。本科在中国工程院院士董建华及国内消化田德禄的领导下，参加“七.五”、“八.五”攻关课题“中医药治疗萎缩性胃炎及癌前病变的研究”，自然科学基金课题“中医治疗酒精性肝硬化的研究”等。其研究成果曾获科技进步奖一项，中医药管理局科技进步三等奖一项，北京市科技进步二等奖一项及三等奖三项。本科拥有目前的电子胃镜、电子结肠镜、十二指肠镜、胃肠动力仪等医疗仪器设备，开设有消化内科门诊及病房、电子胃镜室、电子结肠镜室、十二指肠镜室和胃肠动力室。

北京中医药大学东方医院消化内科主要诊治胃肠和肝胆胰疾病，擅长鉴别各种原因引起的呕吐、腹痛、腹泻、腹水、黄疸、便血、消瘦等消化内科疑难杂症，其特色在于用中西医结合治疗肝硬化（酒精性、肝炎后、胆汁性）、消化性肿瘤（食管癌、胃癌、结肠癌、肝癌、胰腺癌）、胆结石、溃疡性结肠炎、上消化道出血、下消化道出血等疾病。用中医方法治疗食管炎、胆汁返流性胃炎、慢性萎缩性胃炎、顽固性胃十二指肠溃疡、功能性消化不良、习惯性便秘、脂肪肝、肥胖等疾病。

北京中医药大学东方医院消化内科内镜室能开展食管静脉曲张套扎术/硬化术、食管狭窄扩张术/贲门失迟缓症扩张术、食管支架置放术、逆行胰胆管造影和镜下取石术、胆道内支架引流术、急性胰腺炎、慢性胰腺炎及胰管结石治疗术、经胃胰腺假性囊肿内引流术、胆道镜技术、内镜下胆道液电碎石术、消化道息肉内镜下电切术、胃结石碎石术、经皮胃造瘘术、各种异物取出术、小儿逆行胰胆管造影、肠道狭窄支架放置术、肝活体组织穿刺术，无水酒精注射治疗肝囊肿、肝动脉导管栓塞和化疗治疗肝癌术等新技术和新项目。目前拥有3名、副3名、主治医师若干名。