西医治疗：
1. 一般治疗：注意外阴部清洁卫生，避免混乱的性关系及与性病病人接触。
2.药物治疗：1%酞丁胺膏涂擦，每日3次，6周为一疗程。5一氟脲嘧啶、争光霉素局部敷贴，有一定效果。
3.物理疗法：电灼、冷冻或激光治疗破坏疣组织。
4. 手术治疗：对病灶大或多次复发者采用手术切除病灶组织。
5. 免疫疗法：适于顽固性病例，病损范围大，不易切除或治疗后复发者。采用尖锐湿疣自家疫苗注射，每次0.5ml，每周1次。3周后湿疣逐渐变干，根部脱落，新的组织愈合。
中医治疗：本病治疗，多因部位不同，而应用不同的方法。大体上以手术切除为主，配合药物疗法.药物疗法分内服与外用，各有所长。内服药主要以解毒除湿为主。
一、辨证进方
偏湿热者;治宜清热除湿解毒。方用：龙胆泻肝汤。龙胆草15g，山桅子10g，黄芩10g，车前于15g，木通10g，泽泻15g，生地15g，当归20g，甘草10g，柴胡10g。
偏气滞血瘀者：治直活血通络，方用治疣方(经验方)。灵磁石20g，紫贝齿20g，代赭石15g，生牡蛎15g，桃仁10g，红花10g，山慈姑10g，白芍10g，地骨皮15g，黄柏10g。
二、专方验方
1. 马齿苋合剂：马齿苋30g，紫草15g，败酱草20g，大青叶15g。加水适量，煎服。有清热解毒，凉血祛瘀之功效。
2. 苦参15g，防风15g，蛇床子10g，车前子20g。加水适量，煎服。可有除湿止痒，利尿通淋之功效。
三、其它疗法
1.中药外洗法：板蓝根、大青叶各50g，苦参30g。煎水外洗病变部位，每日3次。具有解毒除湿止痒的作用，适用于长在皮肤表面或粘膜暴露部位的疣。
2.用l: 8000高锰酸甲溶液外洗，擦干后扑三石散或枯矾散。
3.鸦胆子油点徐惠处。
4. 液氮冷冻疗法。
中药治疗：苦参片：口服每次4～6片，l日3次。若为栓剂，可每晚1粒塞入阴道内。燥湿解毒。本方功能：清热燥湿，抗菌消炎，利尿，用于本病伴有阴道炎之证。
中西医结合治疗： 由于本病尚无固定的某种最佳治疗方法，因此，中西医结合治疗，具有独到之处。
1. 手术切除病灶较大，影响正常生理活动的疣，可使机体在短时间内恢复健康。术前应选用中西医方法，消除兼证。
2. 液氮冷冻具有仅仅破坏疣组织，损伤较小的特点，应用也很广泛。
3．本病多伴有淋病或曾患淋病，因而正确应用抗生素治疗，能起到断绝发病的刺激因素，抵抗泌尿系统感染及阴部粘膜组织感染。方法可选择对淋菌有特异性的抗生素，配合口服中药，除湿解毒利尿，如五苓散等。还可同时应用中药外洗，以提高疗效。
4. 治疗本病，需及时、彻底，避免染及他人。