儿童各年龄组消化道出血的常见病因有所不同，可由消化道局灶病变引起，亦可为全身疾病的局部表现，大致分为四大类原因：
1.消化道疾病
胃肠道局部病变出血，常见病因有食管静脉曲张(门静脉压增高症)、溃疡病出血、胃黏膜异位或迷生、肠息肉脱落、胃肠道血管瘤、肠重复畸形等。
2.感染性疾病
如新生儿败血症、出血性肠炎、肠伤寒出血、胆道感染出血等。
3.出血性疾病
如新生儿自然出血、过敏性出血(特别是过敏性紫癜)、血友病、白血病等。
4.少数“无痛型”急腹症出血
如新生儿(肠回转不良症)、休克型肠绞窄以及少见的无痛型肠套叠(症状以休克及出血为主)。