核医学科建立于七十年代，是厦门市早建立的核医学专业，也是福建省早建立的核医学专业科室之一。目前核医学科包括闽南PET中心、ECT室、体外分析室、核医学专科门诊等，学科规模进入国内先进行列。拥有职称6人，其中博士生导师1人、硕士生导师1人。学科带头人吴华系享受津贴，担任中国医学装备协会核医学装备与技术委员会副主任委员、中国核学会核医学分会常务理事、中华医学会核医学会全国委员、福建省核医学会副主任委员和《中华核医学杂志》常务编委等，并担任自然科学基金委员会评审组成员。全面开展了核医学的各项医疗项目，包括核素ECT显像、体外检测（各种激素和肿瘤标志物）、核素治疗等，2007年引进代表国内新水平的分子医学影像设备PET/CT和医用回旋加速器，成为闽南地区经卫生部批准的PET中心。医疗业务范围包括甲亢和甲状腺癌的的碘-131治疗；骨转移肿瘤的核素内照射治疗；放射性粒子植入治疗恶性肿瘤；Sr-90皮肤敷贴治疗；通过PET/CT和ECT全身各脏器断层扫描以及肿瘤标志物血检进行肿瘤的诊断和治疗监测；全身骨扫描早期筛查肿瘤骨转移；冠心病和心脑血管疾病早期诊断；癫痫病灶诊断；甲状腺疾病的鉴别；肺栓塞的诊断；甲状旁腺功能亢进的诊断和病灶定位；心、肾、甲状腺、唾液腺和胃排空功能检测；胃肠道出血部位检查，肿瘤前哨淋巴结的探测等。承担本科、研究生和进修医师的教学与培训工作，并可招收博士、硕士研究生以及博士后研究人员。主持完成自然科学基金项目1项，参加完成自然科学基金重大项目1项，主持完成教育部回和人事部项目2项。目前负责自然科学基金项目1项和福建省自然科学基金重点项目1项。近5年发表论文100余篇，其中30余篇在SCI收录期刊发表。