上海交通大学医学院附属新华医院耳鼻咽喉-头颈外科成立于1958年，目前为卫生部临床重点专科、卫生部新生儿听力筛查组组长单位、及上海市人工耳蜗植入指定单位、上海交通大学医学院耳科学研究所及上海市听力障碍诊治中心所在地。

科室现有床位100张，年手术量达4000台以上，目前学科下设耳科、鼻科、咽喉科、头颈外科、小儿耳鼻咽喉科等三级学科，手术范围涵盖耳鼻咽喉-头颈外科各个领域，临床诊疗水平达到先进水平。

近年来着重于学术梯队建设，学科基础设施得到进一步完善，师资队伍建设取得成效，科研实力明显增强。由具备专业特长的学科骨干担任各三级学科带头人。于2008年牵头成立了上海交通大学医学院耳科学研究所，并相继成立了颞骨显微解剖实验室、听觉科学实验室、聋病分子生物学实验室及内耳发育与再生实验室等四个重要科研平台。

在基础设施不断完善的前提下，科室在人才引进和培养上也取得了喜人的成绩。目前，现科室有在编医师及研究员22人，其中6人，副9人，团队带头人及骨干先后入选“上海市学科带头人”、“上海市领军人才”、“上海市曙光计划”、“上海市浦江计划”等人才培养项目，另聘有1位顾问、1位客座，形成了强大的学科人才梯队。科室先后派遣五名中青年学术骨干赴世界各耳科中心学习工作，又从国内外引进多名专业人才，全力打造一流的耳科学研究所和听力中心。

长期以来，科室集中力量对听觉障碍及颅底外科进行系统的基础与临床研究，先后获得卫生部重大专项基金、科技部973/重大科学研究计划、卫生部临床重点专科建设基金、自然科学基金、上海市重大及重点科研基金多项，总研究经费达5000万以上。许多研究成果发表在国内外重要学术期刊上。近年来受卫生部委托，负责全国的新生儿听力筛查及干预工作，取得良好效果。

每年主办多次性或全国性学术交流，产生了较大的影响。本科目前为硕士、博士及博士后培养点，为级颞骨解剖及手术培训基地，每年举办多期继续教育学习班。