广西医科大学第五附属医院胃肠外科主要从事胃肠道肿瘤、腹部肿瘤、腹部外伤、消化性溃疡及并发症及各类急腹症的临床诊疗、科研和教学工作。开展床位50张。技术力量雄厚。常规开展胃肠外科各类手术。近几年大力开展腹腔镜手术，目前已完成数千例腹腔镜下各段大肠癌术、胃癌术，胃大部分切除术、胃穿孔修补，小肠肿瘤切除、阑尾切除术、肠粘连松解术、腔镜甲状腺手术。其中腹腔镜下大肠癌术、阑尾切除术已获2004年度医院新技术一、二等奖，腹腔镜肠粘连松解术和腔镜甲状腺手术获得2005年度医院新技术三等奖。