太阳磁暴一般会存在免疫能力下降、神经系统症状、睡眠障碍、感官系统症状、心血管系统症状等影响和危害。若期间存在不适，建议及时去医院进行检查和治疗。
1、免疫能力下降：太阳磁暴对松果体分泌褪黑素会有一定影响，可能就会影响免疫系统正常运行，从而致使免疫能力下降，易增加疾病发生几率。
2、神经系统症状：在太阳磁暴期间，若对磁场较为敏感，可能会致使神经系统传递处于异常状态，从而造成神经系统不良症状，如头晕、头痛等。
3、睡眠障碍：太阳磁暴主要影响的是地球的电磁环境，人体生物钟和地球的磁场也紧密相关，因此就易出现睡眠障碍，如失眠、多梦、睡眠不足等。
4、感官系统症状：太阳磁暴发生时，部分地区的噪音会变大，长时间接触或是对于噪音较敏感的群体，可能会出现耳鸣、眩晕、短暂耳聋等症状。
5、心血管系统症状：在太阳磁暴发生后，太阳的活动会增强，此时磁场扰动可能就会影响机体血液循环，从而引发高血压、心律失常等。
太阳磁暴期间建议适当的多休息，同时也要调整好心态，以免过于紧张或焦虑，从而增加机体不适感。