上海华山医院消化科成立于1964年，现为复旦大学消化疾病研究所所长单位和临床重点专科建设单位。同时也为华山医院分子与转化医学研究所疑难病例研究部主任单位。

科室拥有教育部“长江学者”奖励计划特聘1名；“杰出青年基金”获得者1名；人事部“新世纪百千万人才工程级人选”1名，教育部“新世纪人才”资助计划1名，上海市“千人计划”1名，赛克勒中国医师“年度奖”获得者1名；复旦大学“特聘”1名，上海市“学科带头人”1名，上海市“领军人才”1名。正、副9名，硕博导5名，设有博士后流动站。

针对消化系统常见和危急重症及疑难病，科室提供个体化、高质量临床医疗服务，在消化系肿瘤个体化治疗和各类疑难肝病诊治方面具有特色，另外，消化内镜介入治疗肿瘤也处于国内领先地位。先后承担各类科研项目近10余项，包括自然科学基金课题，科技部“863”及“973”课题等。

学科带头人刘杰为教育部“长江学者”奖励计划特聘、“杰出青年基金”获得者、复旦大学特聘、上海市领军人才、上海市学科带头人。