沙眼衣原体核酸检测通常当天是可以出结果的，大部分医院上午送检，下午就可以拿到结果，沙眼衣原体核酸检测属于病原学检查，用于确诊是否有沙眼衣原体感染。沙眼衣原体容易感染人体的眼部结膜组织和泌尿生殖道黏膜等。