宫颈小囊肿可能与生理性变化、不良生活习惯、子宫颈局部损伤、慢性宫颈炎、安装宫内节育器等多种因素有关，一旦出现囊肿及时就医诊断，选择适宜的方法治疗。
1、生理性变化：宫颈转化区内，鳞状上皮取代柱状上皮期间，新生的鳞状上皮容易覆盖或伸入宫颈腺管口，从而阻塞将腺管口，导致腺体分泌物引流受到阻碍，最终潴留形成囊肿。这是正常的生理现象，通常不用特殊处理。
2、不良生活习惯：受不良饮食习惯、缺乏运动、不洁性生活等因素的影响，导致身体免疫力下降，可能会增加宫颈小囊肿的发生风险。建议保持良好的生活习惯，避免疲劳过度，不宜进行不洁净的性生活，必要时通过激光进行治疗。
3、子宫颈局部损伤：分娩或人工流产等多种因素均会损伤子宫颈，导致腺管口狭窄或阻塞，致使分泌物不能正常排出，严重者可能会形成囊肿。患者可在医生指导下使用注射用头孢曲松钠、阿奇霉素胶囊等药物治疗，同时配合热敷或坐浴处理，能够舒缓宫颈区域，控制病情进展。
4、慢性宫颈炎：发病后炎症不断刺激宫颈组织，致使宫颈出现充血、水肿及炎性细胞浸润现象，甚至会阻塞宫颈腺管口，影响分泌物排出，一旦加重可能会形成小囊肿。病发后需进行全面检查，遵医嘱选择冷冻、高频电波等方法进行治疗，同时注意个人卫生。
5、安装宫内节育器：如果女性安装宫内节育器，与身体产生排斥反应，引起细菌感染，且得不到有效治疗，容易引起宫颈小囊肿。建议及时取出宫内节育器，并且注意个人卫生，同时遵医嘱服用宫瘤消胶囊、头孢克肟胶囊等药物治疗。
所有女性都应当关注宫颈健康，平时做好预防工作，一旦出现异常立即就医处理，同时定期复诊检查，观察病情恢复情况。