2009年2月，合蚌高速铁路设计方案通过审核，设计文件显示将在安徽省淮南市大通区九龙岗镇设淮南东站。2011年5月，淮南东站主体工程建设完工，站房进入内部装修和设施设备的安装阶段 。2012年10月16日，淮南东站随合蚌高速铁路的开通而投入运营。2019年11月12日，淮南东站启动电子客票应用实施推广工作。淮南东站为中型旅客车站，主体为两层，局部为三层。淮南东站站房左侧是出站口，出站口直通地下商场；右侧是售票处。淮南东站设有一个基本站台，一个中间站台。淮南东站地下广场呈T形布局，中央为商业区，东西两侧分别是出租车和社会车辆停车场，另有地下人防工程及车辆、行人出入口。地上园林景观部分，中间为疏散及中轴广场，东边为下沉式广场，西边为水体景观，四周9米宽的环状沥青通站匝道与站前道路相接。