病理科是医院重要诊断科室之一，承担医疗、教学、科研任务。重点基础研究发展计划（973）课题实验室。目前有医务人员16人，其中1人、副3人、主治医师5人、医师1人、实验师及主管技师8人；硕士生导师2人、博士2人、硕士5人。学科带头人张锡流为中华医学会广西病理分会副会主任委员及广西临床病理质量控制中心副主任、广西抗癌协会肿瘤病理专业委员会副主任委员、广西医师协会临床病理科医师分会副会长。科室大部分医务人员都曾到北京大学医学部、中国人民总医院、北京大学医学部、中国人民总医院、北京军区总医院、复旦大学附属上海肿瘤医院、南京大学附属鼓楼医院和四川大学华西医院等学府进修学习。

拥有英国SANTON全封闭自动脱水机及组织包理机、德国LELCA冷冻切片机和石蜡自动切片机、日本OLYMPUSBX60及50荧光显微镜、郎珈公司图文分析系统病理工作站、生物解剖显微镜等精良医疗设备。下设病理诊断室、组织取材室、常规制片室、免疫组织化学实验室、分子病理实验室、细胞学制片室、图文分析室等。可开展常规病理、细胞病理（TCT及DNA定量分析等）、冷冻快速病理、免疫病理（免疫组化及免疫荧光等）、分子病理（原位杂交）、接收全区病理会诊和培养进修生等工作。每年完成外检量进15000例，脱落细胞检查近10000例。病理科长期践行”一切以病人为中心，不断提高医疗质量，救死扶伤、教书育人“的使命。在全国中医药院校中首先实行大学病理教学人员与附院临床病理诊断人员二为一管理模式是我科的特色，因此，具有扎实理论基础和丰富诊断经验的医师有了发挥理论联系实际的平台。病理诊断技术与全国接轨，诊断水平位列全国中医药院校前茅，在广西病理界处于领先地位，能发挥病理诊断重要作用，成为手术科室的坚强后盾。

近五年来，主持省级课题6项，厅级课题6项，院级课题5项，参与20余项级、省级科研课题研究。获中华中医药学会科学技术二等奖1项，广西科技进步三等奖3项，广西医药卫生适宜技术推广奖二等奖1项，广西医药卫生适宜技术推广奖三等奖3项，院级教学成果三等奖1项。主编校内教材4部，副主编全国中医药学院《病理学》和《病理学学习指导》教材及实验教材5部，参编全国中医药院校《病理学》、《病理生理学》教材12部，参编病理诊断专著4部，发表论文140余篇。获广西中医药大学十佳教师1人，广西中医药大学教师1人，广西中医药大学附属医院十佳教师1人。