先天性下颌瞬目综合征，如果症状较轻，可能会自愈。如果症状严重者，多不会自愈，需要到正规机构，通过手术的方式干预。
先天性下颌瞬目综合征是一种比较特殊类型的上睑下垂，并且伴随上肢肌功能不全，但是在做张口、咀嚼等下颌运动时，上睑下垂会消失。患者要及时到正规机构就诊，明确病情严重程度，对于症状较轻的患者，多不用特殊治疗，部分患者还可能在青春期后出现自愈的情况。
对于症状较严重的患者，上睑下垂和下颌运动之间的关联更为明显，还可能伴随部分性眼肌麻痹和内斜视等。这种情况自愈的可能性较小，需要及时遵医嘱通过上睑提肌整形术，将不能发挥正常功能的上睑提肌和其所支配的神经进行矫正。上睑提肌整形术，一般参考价格2000~10000元，1-3个月局部状态可见一定改善，可能存在矫正不足、矫正过度、眼睑闭合不全等风险。
先天性下颌瞬目综合征患者在治疗期间要避免剧烈运动，同时保持清淡和高营养的饮食习惯，多吃新鲜蔬菜和水果。