心脏内科病房主要收治来自全国各地的各类严重心律失常、暴发性心肌炎、感染性心肌炎、扩张型心肌病、限制型心肌病、肥厚型心肌病、充血性心力衰竭、感染性心内膜炎、川崎病、高血压、心包积液等各类心脏内科系统疾病，收治专业病人数约150-170人次/月，居全国首位。

心内科导管室具备先进的EnsiteNavX三维标测系统，其优势主要表现为更快速找到消融靶点、缩短手术时间，使得射频消融治疗小儿快速型心律失常的手术成功率高达95%以上，并有效减少并发症及复发率;显著减少X线曝光，对于房室结双径路的消融甚至可达到零曝光，极大程度地保护了患儿和术者的健康;在某些血流动力学不稳定或不易诱发的心律失常的消融中更具优势。该科目前每年在Ensite系统三维标测引导下完成小儿心律失常射频消融治疗等百余例，处于国内外儿科领先水平。射频消融主要病种包括室上性心动过速、室性早搏、特发性室性心动过速、房性心律失常等，小儿慢性心律失常的起搏器安装治疗技术、小儿川崎病合并冠状动脉并发症的选择性冠状动脉造影诊断技术。