重庆医科大学病毒性肝炎研究所建于1979年，1981年成为全国首批博士学位授予点，1995年成立博士后流动站，1983年成为首批卫生部指定的全国肝炎药物临床药理基地，1989年被教委批准为全国高等学校医学重点学科，1995年被批准为四川省重点实验室。1997年成为重庆市肝部治疗研究中心。1999年被评为重庆市感染性急病分子生物学重点实验室，获得教育部设立的“长江学者计划”特聘岗位。2001年再次被教育部评为内科学（传染病学）级重点学科，并且被列为重庆市“十五”期间重点建设的重点学科。同时也是《中华肝脏病杂志》承办单位和编辑部所在地。

研究所现有研究人员31人，其中8人（博士生导师6名），副8人。拥有120多套高精密仪器，总价值800万元左右。自“六五”以来，一直承担着自然科学基金项目中有关病毒性肝炎发病机理及其防治的研究课题，取得了丰硕的成果。共承担攻关计划及自然科学基金项目及省级重点科研项目50余项，目前在研15项。取得的科研成果，获得?卫生部、四川省及重庆市等单位的嘉奖21项。研究所已发展成为集科研与临床于一体，基础理论与应用开发相结合的全国性肝炎研究与治疗中心。