大坪医院呼吸科是我院重点学科，为硕士学位授予点，目前正积极准备申请学校博士授权学科。1978年院所开始组建呼吸内科，1988年独立成立呼吸内科，设有床位41张，展开床位50张，好转率96%，病房内分设内镜诊疗室、肺功能检查室、血气分析检查室和睡眠呼吸障碍诊疗室及RICU。有一支以博士、硕士为主体的医疗队伍。

科室现有主系列11人，辅系列5人，其中1名，副3名，主治医师、讲师7名。硕士以上学历者占80%，其中已获或在读博士学位的达8人。10余项新开展的重要诊疗技术与方法总计完成2000余例次，逐渐在呼吸领域形成了自身的医疗特色，其中肺间质疾患的诊治、COPO的基础研究和治疗、晚期肺癌的综合治疗、哮喘的基础研究和临床治疗、睡眠障碍的诊治更具独到之处。

并与时俱进的开创了呼吸科微创治疗带动学科发展，如纤支镜作胸腔镜对胸膜疾病的诊断和治疗、支气管腔内肿瘤的电凝疗法、支气管动脉栓塞疗法治疗大咯血、支气管动脉灌注化疗药物治疗晚期肺癌、经皮穿刺肺活检、电视胸腔镜肺活检对肺弥漫性疾病的诊断等。科室主任和学术带头人崔社怀、博士、硕士生导师，为重庆市中青年呼吸病，中华医学会重庆市分会呼吸专委会委员、肿瘤专委会副主任委员、结核专委会副主任委员，在其带领下，经过多年努力，呼吸内科在专业上形成了自己的学术优势和诊疗特色，在重庆市享有较高的声誉。承担自然基金科研课题一项，院校科学基金资助课题3项，招收硕士研究生5名。全科近5年在国内统计苑期刊上发表学术论文近百篇，获各种科研经费近30万元，获得军队科技进步二等奖2项、三等奖3项，获专利1项。