男性精子畸形治疗是否麻烦，需要根据引起的原因进行综合判断。如果是不良生活习惯引起的，并不麻烦；如果是由生殖系统感染、精索静脉曲张等疾病导致的，则比较麻烦。
一、不麻烦
1.不良生活习惯：若患者长期吸烟酗酒或经常熬夜，可能会对精子的质量造成影响，从而出现精子畸形的情况。此时一般并不麻烦，在戒烟戒酒后可逐渐恢复。
二、麻烦
2.生殖系统感染：如附睾炎、前列腺炎等，由于炎症刺激会导致局部组织受到损伤，也会使精子发生异常改变，进而会出现上述情况。通常是比较麻烦的，可以遵医嘱服用抗生素类药物来改善病情，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟片等。
3.精索静脉曲张：通常是久站、剧烈运动等因素造成的，患病以后会使血液回流受阻，甚至还会导致局部缺血，从而使精子质量下降，诱发精子畸形的现象。这种情况也是比较麻烦的，可以通过手术的方法来进行治疗，比如腹腔镜下精索静脉高位结扎术、显微镜下精索静脉栓塞术等。
除此之外，还可能与遗传因素有关，建议及时就医进行检查并治疗。
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