该院针灸科为临床重点专科、教育部针灸推拿特色专业、中医药管理局重点学科、中医药管理局重点专科、全国针灸协作组组长单位、腰痛病协作分组组长单位、江西省医学领先专业、江西省重点专科、江西省特色专科、江西省针灸临床研究基地、江西省卫生厅南方灸疗中心、江西省教育厅示范性硕士点、江西省教育厅针灸专业、江西省卫生厅针灸领先专业、江西省艾灸技术创新团队、江西省首批优势科技创新团队。

该科以的针灸学家、博士生导师陈日新创立的“热敏灸”治疗中风病、腰痛病等多种疾病为特色，技术力量雄厚，病种专科齐全，形成了集诊断、治疗、康复、预防等为一体的规范化防治体系，在国内外享有较高的声誉，目前开放床位数55张。

该科拥有一支技术精湛、团结协作、不断进取的专科学术创新团队，集临床、教学、科研于一体。目前科室共有专科医师7人，/主任（中）医师2人，副/副主任（中）医师1人，讲师/主治（中）医师1人，助教/住院（中）医师3人，博士学位2人，硕士学位3人，其中博士生导师1人，硕士生导师1人，江西省卫生厅首届“有突出贡献中青年”1人，江西省有突出贡献1人，享受特殊津贴1人，全国教师1人，全国卫生系统先进工作者1人，全省卫生科技工作先进个人1人，江西省卫生系统高层次学术技术带头人1人，江西省高等学校首届与历届中青年学科带头人1人。

该专科医疗特色突出，在国内外享有极高的声誉，以陈日新创立的“热敏灸”艾灸法、“力敏”推拿等一系列成果的研究和临床应用作为主要特色。开辟了缺血性中风、腰痛病、面瘫病等多种疾病治疗的新模式。目前已开展多种特色疗法，其中包括热敏灸技术、针刺技术、力敏推拿技术、力敏穴位无痛刮痧技术、二十四节气热敏铺灸、敏化穴位麦粒灸、针刀技术、火疗技术、埋线技术等，其中热敏灸、力敏推拿为本专科主攻疾病的核心特色技术。目前针灸专科临床治疗常见病种达100余种。