板蓝根对扁平疣的治疗效果甚微，临床上一般不建议喝板蓝根治疗扁平疣，尽早选择其他治疗措施。
板蓝根是清热解毒、凉血利咽的传统中成药，适用于肺胃热所致的咽喉肿痛、口咽干燥，对急性扁桃体炎有较好的缓解作用。而扁平疣是人乳头瘤病毒感染皮肤所致，可在面部、手背、前臂等部位看到扁平样的小丘疹，偶有瘙痒，但不属于板蓝根的适应症范畴内，不建议使用板蓝根治疗扁平疣。如需治疗可遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物，或可选择光动力治疗、冷冻治疗、手术切除等。
日常生活中应保持皮肤清洁，不要搔抓或抠挖皮损处，饮食应保持清淡易消化，忌食辛辣刺激性食物，居住室内勤开窗通风，每天保证充足的睡眠时间，注意劳逸结合，避免过度劳累。