缺血性脑卒中的治疗要尽快恢复脑部的血管供应，在药物上要在三个小时内给予溶栓药物。阿斯匹林可以在急诊室让患者服下，组织纤溶酶原激活剂可以4个半小时内通过静脉给予。在治疗手段上动脉导管直接将组织纤溶酶原激活剂送到栓塞部位，或者动脉导管粉碎栓塞或者将之去除。这种办法如果在脑卒中后三个小时内实施，收效最好。

为了预防脑卒中的再发生，或者进行颈动脉内膜切除术以取出硬化，或者做血管成形术和支架。

出血性脑卒中的治疗着重于控制出血和减轻脑部的压力。如果患者服用抗凝剂的话，要给药或者输血加以稀释，还要服用降压药以预防血管痉挛和癫痫。出血止住后，进行辅助治疗以帮助身体吸收出血。如果出血面积大的话，需要手术处理。

血管异常的处理通常靠手术，有几种选择，手术夹闭、血管内栓塞治疗、手术切除AVM、颅内旁路、立体定位放射治疗。