2005年9月16日，根据《广珠城际快轨拱北站、前山站配套设施及拱北东规划区城市规划（前期）研究》项目计划书，珠海站被规划为综合交通枢纽站。2009年，广珠城际铁路珠海站开始建设。2009年至2011年4月，广珠城际铁路珠海站建设长期停滞不前。2010年6月，广珠城际铁路珠海站完成各项招投标开始进场施工。2011年1月，广珠城际铁路珠海站完成主要的迁改工程。4月，广珠城际铁路珠海站全面复工。8月，广珠城际铁路珠海站完成土方开挖。2012年1月，广珠城际铁路珠海站完成桥梁墩柱和帽梁施工。4月，广珠城际铁路珠海站完成地下室主体结构施工 。7月24日，广珠城际铁路珠海站主体结构基本完成。12月31日，广珠城际铁路珠海站正式开通运营。2014年1月20日，珠机城际铁路建设开工，起于广珠城际铁路珠海站。2016年1月2日，珠机城际铁路珠海站进站施工。2019年4月30日，珠机城际铁路珠海站完工。11月，首列动检车从珠海站开出，珠机城际铁路一期开始联调联试。