百日咳睡醒后容易咳嗽可能与疾病特征、呼吸道分泌物刺激、室内空气不佳、迷走神经兴奋、机体免疫反应等有关，可通过一般治疗、药物治疗等方式缓解，建议到正规医疗机构就诊，面诊后根据患者自身情况遵专科医师意见选择合适治疗方式。
1.疾病特征：百日咳是由百日咳杆菌引发的急性呼吸道传染病，其特点之一是阵发性、痉挛性咳嗽，睡醒后就会很容易咳嗽。患者可遵医嘱使用罗红霉素胶囊、阿奇霉素分散片等药物，抑制百日咳杆菌的生长，促进病情恢复，还可使用拍背、吸痰等方法帮助排痰。
2.呼吸道分泌物刺激：在睡眠期间，呼吸道分泌物可能会积聚在呼吸道内，睡醒后，由于体位改变或呼吸运动，这些积聚的分泌物会刺激呼吸道黏膜，引发咳嗽反射，以便将分泌物排出。患者可遵医嘱使用布地奈德吸入气雾剂、沙丁胺醇吸入气雾剂等药物，将其转化为气雾吸入，以扩张支气管、减少痰液积聚，并促进痰液排出。鼓励患者进行深呼吸、咳嗽等动作，以协助排痰。
3.室内空气不佳：如果室内空气干燥，可能会导致呼吸道黏膜干燥，导致呼吸道分泌物更加黏稠，不易咳出，进而在睡醒后刺激呼吸道引起咳嗽。定期开窗通风，保持室内空气流通，以减少空气中的细菌、病毒等病原体。或者使用空气净化器等设备，过滤空气中的有害物质，提高室内空气质量。
4.迷走神经兴奋：夜间迷走神经相对兴奋，导致支气管平滑肌收缩，使呼吸道变得狭窄，睡醒后，迷走神经的兴奋状态逐渐减弱，支气管平滑肌开始舒张，此时呼吸道内的分泌物更容易刺激呼吸道黏膜，引起咳嗽。患者可遵医嘱使用镇静剂类药物，如地西泮片、阿普唑仑片等，缓解症状，睡前不宜进行跑、跳等剧烈运动，以免加重迷走神经兴奋。
5.机体免疫反应：百日咳杆菌感染后，机体会产生免疫反应，在睡醒后，由于机体从睡眠状态逐渐清醒，免疫反应可能更加活跃，从而导致咳嗽更频繁。患者可遵医嘱使用免疫调节药物，如干扰素、白介素等，以调节机体免疫功能，减轻免疫反应对呼吸道黏膜的损害。
日常生活中应合理安排饮食，宜清淡、易消化，多选择白粥、清汤面等食物，外出正确佩戴口罩，做好隔离措施，以减少交叉感染的风险。