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1、在协议离婚中， 婚前协议约定子女抚养权不能违反法律原则，对于孩子的抚养权问题的约定，在离婚时才能确定其是否有效。如按照《婚姻法》第三十六条规定，离婚后，哺乳期内 的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。
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在诉讼离婚中，一般会按照离婚时双方的意愿及情况，以子女的最大利益和成长需要为先，确定抚养权的归属。
2、婚前协议属于特殊性质的合同，按照《合同法》第五十六条的相关规定，合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。所以如果关于约定子女抚养权的条款因违反法律的规定或者不利于子女的成长而无效，不影响婚前协议其他部分的效力。
离婚案件中就孩子抚养问题，法庭会根据不同情况作出不同的判决;
1、如果双方可以就孩子抚养协商一致，按照双方当事人的意思出具判决书;
2、如果双方不能就孩子抚养协商一致，法院会按照一人抚养一个子女的原则进行判决;
3、判决抚养的时候法院会参考孩子的年龄，性别等因素进行判决，通常情况下，两周岁以内的子女原则上女方抚养，两周岁到十周岁之间的子女法院会按照有利子女成长的原则判决，十周岁以上的子女可以征求孩子意见。