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支票发票不符说明企业实际发生的交易事项存在虚假的可能性，该发票会受到主管税务机关的稽查，同时主管税务机关会对稽查后不合规的发票要求企业进行作废或红字冲销，以及根据实际情况要求企业进行处理。由于发票的开具和接受是反映企业交易事项真实性的依据之一，因此企业所收到或所开出的支票金额应当与发票上的金额一致，以证明企业未存在虚假经营的行为。同时企业在开具发票后应及时同步上传发票信息，并在规定的期间内及时完成增值税的纳税申报。
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开具与实际经营不符的发票会怎么样
开具与实际经营不符的发票处理是由税务机关没收违法所得，虚开金额在1万元以下的可以并处5万元以下的罚款，虚开金额超过1万元的并处5万元以上50万元以下的罚款，构成犯罪的依法追究刑事责任。
销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票，取得发票时不得要求变更品名和金额。不符合规定的发票，不得作为财务报销凭证，任何单位和个人有权拒收。
发票是指一切单位和个人在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的业务凭证，是会计核算的原始依据，也是审计机关、税务机关执法检查的重要依据。收据才是收付款凭证，发票只能证明业务发生了，不能证明款项是否收付。
发票是指经济活动中，由出售方向购买方签发的文本，内容包括向购买者提供产品或服务的名称、质量、协议价格。除了预付款以外，发票必须具备的要素是根据议定条件由购买方向出售方付款，必须包含日期和数量，是会计账务的重要凭证。中国会计制度规定有效的购买产品或服务的发票称为税务发票。政府部门收费、征款的凭证各个时期和不同收费征款项目称呼不一样，但多被统称为行政事业收费收款收据。为内部审计及核数，每一张发票都必须有独一无二的流水账号码，防止发票重复或跳号。
《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。
任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：
（一）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（二）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。
发票明细与实际不符处罚
发票明细与实际不服的处罚。
我国法律规定：开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。违反法律的规定虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
法律依据
《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。
任何单位和个人不得有下列虚开发票行为:
(一)为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票
(二)让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票
(三)介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。"
开具的增值税发票和支票金额不符会怎样？急
税票和支票不一致，在企业的经营活动中是很正常的现象。你的问题表述的不是很清楚，到底你们是供货方，还是对方？现在就假设你是供货方：
就拿你举例来说，货款是10000元，没有包括对方付给的运费500元，这其实很正常，500元运费，肯定是你公司帮对方垫付的，对方通过支票汇款给你们，这个也很正常。500元运费，肯定不是货款，当然可以不在同一发票开具。所以说，增值税发票可以不做作废处理。500元运费，可作为其他应付款处理，待以后业务完结，再做相关账务结转处理。
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